一位修女走进了夜店，她瞬间吸引了在场所有人的目光。她熟练的走到电唱机前，点了一首爵士乐，然后揪起占座的混混，成功在吧台前找到一个位置。
几天前她还是歌舞厅的女王，与黑老大谈恋爱，然而她意外撞见了一场凶杀。老大让她不要声张，但她刚转身离开，就听到屋内的讨论。两个小弟担心事情败露，于是老大下令抓人，黑妹赶紧撒丫子开溜。
她钻出下水道的井盖，很快就来到警局，向警长举报了老大的罪行。警局近期正在进行扫黑打恶专项行动，黑老大正是他们的首要目标，而黑妹作为证人，自然成为警局上下保护的对象。然而黑老大手眼通天，保护工作困难重重。好在警长熟读二十四史，知道保护一个女人，最好的办法就是让她出家。
于是，警长带着黑妹来到了峨眉山修道院，主持灭绝师太。一进门，就看见一个刺头，对方黑着个脸，让师太差点失态。好在神父好言相劝，才让她接下这个烂摊子。
黑妹换上修女服后，开始了全新生活。来修道院的第一件事，就是吃圣餐。但平时吃惯炸鸡的她，对素食毫无兴趣。刚将食物塞进嘴里，就瞬间戴上痛苦面具。她立刻拿来纸巾将圣餐吐了的干净。但这样行为却引起师太不满，不仅让她禁言，还直接收走了盘子。
圣餐结束后，一天的工作也正式开始。趁着众人各自耕种，她将目光锁定番茄，仿佛这红彤彤的果实，是诱惑夏娃的禁果。于是趁着众人不备，她成功将番茄摘走。
在夜幕降临的时候，师太带着黑妹，来到了一个简陋的房间。这里的环境，甚至比不上黑妹家的厕所，但是到如今她也只能将就将就了。隔天一早，天还没亮，黑妹就被叫醒。原来今天是做礼拜的日子，神父让唱诗班开始表演，那余音绕梁的歌声，让原本就不多的信徒，瞬间减少了一大半。
黑妹受够了这种日子，于是打电话给警长，想要离开这里。然而从对方那里得知了一个坏消息，因为警局里有内奸，不少证人死于非命，而她也成为了。指证黑老大的唯一人选。然而她那不守规矩的天性，让她在半夜偷偷去了酒吧，结果却被其他姐妹跟踪，脱离了围墙的束缚。外面的世界让修女们大开眼界。
当三人回来时，正好被院长打了个正着。院长单独将黑妹带进了办公室，苦口婆心的劝她转去斯莱特林修道院，那里的环境更适合她这种"黑巫师"。然而黑妹苦苦哀求，窗外传来的歌声也让院长改变主意。既然黑妹是歌手出身，或许可以给唱诗班帮忙，就这样她被安排了新工作。
然而这群修女的底子太差，只会哆来咪和发唆，还有几个更是五音不全。为了改变现状，黑妹立刻上手，她让不同声部的修女集合，然后分批教导。经过一番努力，效果显著。尽管困难重重，黑妹始终坚持不懈，她以极大的耐心和毅力，引导修女们逐渐掌握歌唱技巧。她的努力没有白费，修女们的歌声逐渐变得和谐动听。
这样的改变，让所有人都感到惊喜和欣慰。这个原本寂静的修道院，因为黑妹的歌声，而焕发出新的生机和活力，而黑妹也找到了新的归属和意义。
时间流转，又一个礼拜天到来，轮到黑妹指挥，她一上台就让众人保持微笑，有了放松的心态，修女们果然表现出色。如此精彩的演唱，让台下的人也颇为惊叹。这一切只是开始，随着黑妹的一个手势，赞美诗的风格也发生了变化，轻松欢快的歌声，让修女们的脸上洋溢着热情的笑容。
这一切出乎了院长的意料，修道院外的混混们也被这歌声吸引。一曲结束后，观众席爆发了热烈的掌声，但院长的脸色难看到了极点，他训斥黑妹，将修道院整得跟KTV似的，还扬言要将其开除。幸好神父来打圆场，高度赞美了唱诗班，称那是天堂的声音。高情商的黑妹儿将功劳都给了院长。
这样一来，她也不得不同意改变，甚至批准修女外出，去街道展开各种工作。电视台前来采访，让原本追杀黑妹儿的黑老大，也找到了她的行踪。原本门可罗雀的教堂，因为修女们的歌声，也变得人声鼎沸起来，甚至教皇本人也要来体验一番。她们也被媒体大肆报道。然而透过电视，黑妹的行踪被黑帮发现。就在教皇来临的这天，黑帮杀手现身，挟持了她和小美。在生命的最后一刻，黑妹深深的明白了自己的处境。在刹车的间隙，她决定将小美推出去，希望她能有一线生机。
小美将刚才的情况传达给了所有的修女姐妹，于是，一场轰轰烈烈的营救行动开始了。即使是与黑妹有过节的院长也主动参与其中，她们希望能租到一架飞机，但得知修女们身无分文后，飞行员果断拒绝了。然而黑妹她们的连珠炮般的祝福，最终打动了飞行员。修女们坐着飞机，成功的到达了目的地。
另一方面，黑妹儿决定再被杀前祷告一番，她的虔诚感动了两个杀手，他们被一箭双雕，黑妹儿逃脱。黑妹儿与修女们汇合后，开始了她们的逃亡之旅。为了更好的掩护黑妹，修女们分散各处，这使得黑帮杀手也束手无策。最终他们从后门逃离，结果还是被杀手堵住。但为了保护其他人，黑妹儿选择挺身而出。
在危急关头，警长及时赶到，成功击中了黑老大，从而救下了黑妹一命。为了庆祝教皇的演唱，电影也即将结束。修女们的精彩演唱，让慕名而来的教皇非常开心。这就是故事的全部，一场充满惊险与奇迹的逃亡之旅。
